Protein–RNA interactions for Protein: P17544

ATF7, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7P17544 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATF7P17544 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATF7P17544 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATF7P17544 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATF7P17544 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATF7P17544 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATF7P17544 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ATF7P17544 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATF7P17544 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATF7P17544 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATF7P17544 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF7P17544 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF7P17544 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF7P17544 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF7P17544 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF7P17544 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF7P17544 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF7P17544 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF7P17544 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF7P17544 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF7P17544 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF7P17544 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF7P17544 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF7P17544 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF7P17544 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF7P17544 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF7P17544 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF7P17544 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF7P17544 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF7P17544 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF7P17544 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF7P17544 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF7P17544 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF7P17544 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF7P17544 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF7P17544 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF7P17544 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF7P17544 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF7P17544 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF7P17544 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF7P17544 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF7P17544 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF7P17544 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF7P17544 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF7P17544 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF7P17544 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF7P17544 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF7P17544 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF7P17544 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF7P17544 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF7P17544 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF7P17544 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF7P17544 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF7P17544 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF7P17544 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF7P17544 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF7P17544 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF7P17544 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF7P17544 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF7P17544 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF7P17544 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF7P17544 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF7P17544 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF7P17544 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF7P17544 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF7P17544 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF7P17544 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF7P17544 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF7P17544 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF7P17544 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF7P17544 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF7P17544 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF7P17544 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF7P17544 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF7P17544 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF7P17544 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF7P17544 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF7P17544 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF7P17544 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF7P17544 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF7P17544 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF7P17544 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF7P17544 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF7P17544 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF7P17544 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF7P17544 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF7P17544 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF7P17544 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF7P17544 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF7P17544 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF7P17544 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF7P17544 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF7P17544 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF7P17544 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF7P17544 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATF7P17544 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATF7P17544 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATF7P17544 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATF7P17544 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATF7P17544 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms