Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA1P17302 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA1P17302 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA1P17302 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA1P17302 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA1P17302 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA1P17302 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA1P17302 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA1P17302 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA1P17302 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA1P17302 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA1P17302 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA1P17302 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA1P17302 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA1P17302 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA1P17302 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA1P17302 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA1P17302 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA1P17302 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA1P17302 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA1P17302 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA1P17302 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA1P17302 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA1P17302 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA1P17302 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA1P17302 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA1P17302 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA1P17302 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA1P17302 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA1P17302 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA1P17302 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA1P17302 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA1P17302 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA1P17302 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA1P17302 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA1P17302 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA1P17302 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA1P17302 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA1P17302 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA1P17302 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA1P17302 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA1P17302 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA1P17302 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA1P17302 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA1P17302 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA1P17302 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA1P17302 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA1P17302 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA1P17302 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA1P17302 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA1P17302 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA1P17302 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA1P17302 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA1P17302 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA1P17302 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA1P17302 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA1P17302 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA1P17302 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA1P17302 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA1P17302 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA1P17302 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA1P17302 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA1P17302 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA1P17302 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA1P17302 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA1P17302 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA1P17302 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA1P17302 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA1P17302 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA1P17302 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA1P17302 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA1P17302 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA1P17302 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA1P17302 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA1P17302 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA1P17302 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA1P17302 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA1P17302 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA1P17302 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA1P17302 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA1P17302 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA1P17302 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA1P17302 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA1P17302 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA1P17302 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA1P17302 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA1P17302 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA1P17302 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA1P17302 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA1P17302 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA1P17302 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA1P17302 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA1P17302 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA1P17302 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA1P17302 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA1P17302 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA1P17302 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA1P17302 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA1P17302 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA1P17302 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms