Protein–RNA interactions for Protein: P16104

H2AFX, Histone H2AX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFXP16104 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2AFXP16104 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2AFXP16104 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2AFXP16104 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2AFXP16104 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2AFXP16104 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2AFXP16104 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2AFXP16104 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2AFXP16104 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2AFXP16104 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2AFXP16104 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2AFXP16104 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2AFXP16104 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
H2AFXP16104 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
H2AFXP16104 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2AFXP16104 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2AFXP16104 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2AFXP16104 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2AFXP16104 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2AFXP16104 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.6 ms