Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME1P15531 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME1P15531 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME1P15531 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME1P15531 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME1P15531 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME1P15531 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME1P15531 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME1P15531 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME1P15531 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME1P15531 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME1P15531 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME1P15531 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME1P15531 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME1P15531 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME1P15531 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME1P15531 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME1P15531 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME1P15531 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME1P15531 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME1P15531 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME1P15531 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME1P15531 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NME1P15531 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME1P15531 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NME1P15531 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NME1P15531 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NME1P15531 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NME1P15531 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NME1P15531 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NME1P15531 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME1P15531 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME1P15531 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME1P15531 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME1P15531 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NME1P15531 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NME1P15531 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME1P15531 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME1P15531 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME1P15531 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME1P15531 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME1P15531 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME1P15531 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME1P15531 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME1P15531 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME1P15531 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME1P15531 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME1P15531 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME1P15531 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME1P15531 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME1P15531 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME1P15531 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME1P15531 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME1P15531 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NME1P15531 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME1P15531 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME1P15531 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME1P15531 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME1P15531 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME1P15531 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME1P15531 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME1P15531 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME1P15531 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME1P15531 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME1P15531 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME1P15531 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME1P15531 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME1P15531 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME1P15531 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME1P15531 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME1P15531 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME1P15531 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME1P15531 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME1P15531 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NME1P15531 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME1P15531 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME1P15531 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME1P15531 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME1P15531 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME1P15531 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME1P15531 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME1P15531 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME1P15531 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME1P15531 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME1P15531 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME1P15531 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME1P15531 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NME1P15531 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NME1P15531 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NME1P15531 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NME1P15531 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NME1P15531 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NME1P15531 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NME1P15531 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NME1P15531 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NME1P15531 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NME1P15531 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME1P15531 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME1P15531 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME1P15531 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms