Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms