Protein–RNA interactions for Protein: P13631

RARG, Retinoic acid receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARGP13631 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARGP13631 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARGP13631 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARGP13631 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARGP13631 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARGP13631 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RARGP13631 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RARGP13631 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RARGP13631 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RARGP13631 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RARGP13631 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RARGP13631 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RARGP13631 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RARGP13631 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RARGP13631 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RARGP13631 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RARGP13631 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RARGP13631 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RARGP13631 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RARGP13631 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RARGP13631 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RARGP13631 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RARGP13631 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RARGP13631 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RARGP13631 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RARGP13631 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RARGP13631 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RARGP13631 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RARGP13631 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RARGP13631 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RARGP13631 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RARGP13631 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RARGP13631 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RARGP13631 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RARGP13631 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RARGP13631 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RARGP13631 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RARGP13631 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RARGP13631 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RARGP13631 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RARGP13631 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RARGP13631 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RARGP13631 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RARGP13631 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RARGP13631 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RARGP13631 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RARGP13631 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RARGP13631 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RARGP13631 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RARGP13631 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RARGP13631 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RARGP13631 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RARGP13631 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RARGP13631 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RARGP13631 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RARGP13631 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RARGP13631 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RARGP13631 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RARGP13631 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RARGP13631 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RARGP13631 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RARGP13631 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RARGP13631 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RARGP13631 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RARGP13631 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RARGP13631 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RARGP13631 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RARGP13631 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RARGP13631 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RARGP13631 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RARGP13631 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RARGP13631 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RARGP13631 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RARGP13631 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RARGP13631 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RARGP13631 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RARGP13631 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RARGP13631 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RARGP13631 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RARGP13631 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RARGP13631 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RARGP13631 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RARGP13631 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RARGP13631 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RARGP13631 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RARGP13631 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RARGP13631 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RARGP13631 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RARGP13631 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RARGP13631 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RARGP13631 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
RARGP13631 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARGP13631 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARGP13631 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARGP13631 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARGP13631 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARGP13631 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARGP13631 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARGP13631 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARGP13631 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms