Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCG2P13521 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SCG2P13521 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCG2P13521 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCG2P13521 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCG2P13521 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCG2P13521 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCG2P13521 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SCG2P13521 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SCG2P13521 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCG2P13521 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SCG2P13521 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCG2P13521 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCG2P13521 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCG2P13521 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCG2P13521 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCG2P13521 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCG2P13521 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCG2P13521 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCG2P13521 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCG2P13521 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCG2P13521 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCG2P13521 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCG2P13521 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCG2P13521 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCG2P13521 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCG2P13521 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCG2P13521 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCG2P13521 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCG2P13521 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCG2P13521 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCG2P13521 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCG2P13521 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCG2P13521 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCG2P13521 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SCG2P13521 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCG2P13521 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCG2P13521 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCG2P13521 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCG2P13521 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCG2P13521 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCG2P13521 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCG2P13521 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCG2P13521 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCG2P13521 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCG2P13521 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCG2P13521 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCG2P13521 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCG2P13521 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCG2P13521 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCG2P13521 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCG2P13521 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SCG2P13521 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCG2P13521 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCG2P13521 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCG2P13521 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SCG2P13521 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCG2P13521 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SCG2P13521 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCG2P13521 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCG2P13521 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCG2P13521 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCG2P13521 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCG2P13521 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SCG2P13521 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCG2P13521 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCG2P13521 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCG2P13521 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCG2P13521 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCG2P13521 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCG2P13521 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCG2P13521 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCG2P13521 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCG2P13521 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SCG2P13521 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCG2P13521 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCG2P13521 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCG2P13521 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCG2P13521 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCG2P13521 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCG2P13521 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCG2P13521 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCG2P13521 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCG2P13521 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCG2P13521 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCG2P13521 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCG2P13521 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCG2P13521 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCG2P13521 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCG2P13521 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCG2P13521 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCG2P13521 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCG2P13521 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCG2P13521 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SCG2P13521 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SCG2P13521 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCG2P13521 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCG2P13521 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCG2P13521 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SCG2P13521 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms