Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RLBP1P12271 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RLBP1P12271 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RLBP1P12271 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RLBP1P12271 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RLBP1P12271 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RLBP1P12271 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RLBP1P12271 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RLBP1P12271 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RLBP1P12271 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RLBP1P12271 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RLBP1P12271 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RLBP1P12271 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RLBP1P12271 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RLBP1P12271 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RLBP1P12271 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RLBP1P12271 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RLBP1P12271 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RLBP1P12271 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RLBP1P12271 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RLBP1P12271 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RLBP1P12271 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RLBP1P12271 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RLBP1P12271 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RLBP1P12271 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RLBP1P12271 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RLBP1P12271 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RLBP1P12271 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
RLBP1P12271 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
RLBP1P12271 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RLBP1P12271 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RLBP1P12271 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RLBP1P12271 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RLBP1P12271 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RLBP1P12271 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RLBP1P12271 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RLBP1P12271 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RLBP1P12271 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RLBP1P12271 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RLBP1P12271 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RLBP1P12271 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RLBP1P12271 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
RLBP1P12271 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RLBP1P12271 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RLBP1P12271 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RLBP1P12271 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RLBP1P12271 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RLBP1P12271 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RLBP1P12271 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RLBP1P12271 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RLBP1P12271 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RLBP1P12271 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RLBP1P12271 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RLBP1P12271 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RLBP1P12271 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RLBP1P12271 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RLBP1P12271 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RLBP1P12271 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RLBP1P12271 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RLBP1P12271 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RLBP1P12271 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RLBP1P12271 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RLBP1P12271 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RLBP1P12271 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RLBP1P12271 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RLBP1P12271 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RLBP1P12271 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RLBP1P12271 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RLBP1P12271 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RLBP1P12271 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RLBP1P12271 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RLBP1P12271 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RLBP1P12271 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
RLBP1P12271 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RLBP1P12271 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RLBP1P12271 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RLBP1P12271 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RLBP1P12271 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RLBP1P12271 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RLBP1P12271 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RLBP1P12271 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RLBP1P12271 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RLBP1P12271 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
RLBP1P12271 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RLBP1P12271 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RLBP1P12271 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
RLBP1P12271 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RLBP1P12271 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RLBP1P12271 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RLBP1P12271 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RLBP1P12271 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
RLBP1P12271 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RLBP1P12271 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RLBP1P12271 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RLBP1P12271 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RLBP1P12271 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RLBP1P12271 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RLBP1P12271 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RLBP1P12271 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RLBP1P12271 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms