Protein–RNA interactions for Protein: P11831

SRF, Serum response factor, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRFP11831 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRFP11831 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRFP11831 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRFP11831 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRFP11831 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRFP11831 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRFP11831 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRFP11831 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRFP11831 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SRFP11831 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SRFP11831 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRFP11831 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRFP11831 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRFP11831 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRFP11831 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRFP11831 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRFP11831 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRFP11831 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SRFP11831 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRFP11831 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRFP11831 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRFP11831 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRFP11831 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRFP11831 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRFP11831 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRFP11831 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SRFP11831 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRFP11831 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRFP11831 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRFP11831 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRFP11831 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRFP11831 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRFP11831 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRFP11831 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRFP11831 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRFP11831 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SRFP11831 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SRFP11831 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRFP11831 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRFP11831 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRFP11831 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRFP11831 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SRFP11831 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SRFP11831 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRFP11831 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRFP11831 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRFP11831 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRFP11831 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRFP11831 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SRFP11831 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRFP11831 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRFP11831 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRFP11831 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRFP11831 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SRFP11831 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRFP11831 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRFP11831 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRFP11831 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRFP11831 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRFP11831 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRFP11831 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRFP11831 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRFP11831 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRFP11831 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SRFP11831 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRFP11831 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRFP11831 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SRFP11831 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRFP11831 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRFP11831 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRFP11831 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRFP11831 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRFP11831 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRFP11831 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRFP11831 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRFP11831 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRFP11831 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRFP11831 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRFP11831 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRFP11831 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRFP11831 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRFP11831 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRFP11831 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRFP11831 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRFP11831 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRFP11831 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SRFP11831 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRFP11831 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SRFP11831 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRFP11831 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRFP11831 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRFP11831 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRFP11831 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRFP11831 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRFP11831 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRFP11831 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRFP11831 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SRFP11831 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRFP11831 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRFP11831 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms