Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HKR1P10072 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HKR1P10072 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HKR1P10072 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HKR1P10072 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HKR1P10072 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HKR1P10072 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HKR1P10072 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HKR1P10072 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HKR1P10072 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HKR1P10072 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HKR1P10072 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HKR1P10072 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HKR1P10072 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HKR1P10072 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HKR1P10072 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HKR1P10072 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HKR1P10072 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HKR1P10072 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HKR1P10072 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HKR1P10072 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HKR1P10072 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HKR1P10072 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HKR1P10072 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HKR1P10072 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HKR1P10072 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HKR1P10072 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HKR1P10072 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HKR1P10072 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HKR1P10072 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HKR1P10072 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HKR1P10072 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HKR1P10072 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HKR1P10072 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HKR1P10072 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HKR1P10072 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HKR1P10072 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HKR1P10072 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
HKR1P10072 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HKR1P10072 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HKR1P10072 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HKR1P10072 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HKR1P10072 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HKR1P10072 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HKR1P10072 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HKR1P10072 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HKR1P10072 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HKR1P10072 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HKR1P10072 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HKR1P10072 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HKR1P10072 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HKR1P10072 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HKR1P10072 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HKR1P10072 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HKR1P10072 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HKR1P10072 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HKR1P10072 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HKR1P10072 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HKR1P10072 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HKR1P10072 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HKR1P10072 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HKR1P10072 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HKR1P10072 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HKR1P10072 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HKR1P10072 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HKR1P10072 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HKR1P10072 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HKR1P10072 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HKR1P10072 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HKR1P10072 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HKR1P10072 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HKR1P10072 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HKR1P10072 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HKR1P10072 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HKR1P10072 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HKR1P10072 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HKR1P10072 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HKR1P10072 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HKR1P10072 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HKR1P10072 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HKR1P10072 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HKR1P10072 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HKR1P10072 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HKR1P10072 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HKR1P10072 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HKR1P10072 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HKR1P10072 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HKR1P10072 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HKR1P10072 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HKR1P10072 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HKR1P10072 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HKR1P10072 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HKR1P10072 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HKR1P10072 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HKR1P10072 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HKR1P10072 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HKR1P10072 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HKR1P10072 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HKR1P10072 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HKR1P10072 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms