Protein–RNA interactions for Protein: P0DL12

SMIM17, Small integral membrane protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM17P0DL12 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms