Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI8

SAA1, Serum amyloid A-1 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA1P0DJI8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAA1P0DJI8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAA1P0DJI8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAA1P0DJI8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAA1P0DJI8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAA1P0DJI8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAA1P0DJI8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAA1P0DJI8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAA1P0DJI8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAA1P0DJI8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAA1P0DJI8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAA1P0DJI8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAA1P0DJI8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAA1P0DJI8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAA1P0DJI8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAA1P0DJI8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAA1P0DJI8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAA1P0DJI8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAA1P0DJI8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAA1P0DJI8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAA1P0DJI8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAA1P0DJI8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAA1P0DJI8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAA1P0DJI8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAA1P0DJI8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAA1P0DJI8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAA1P0DJI8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAA1P0DJI8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAA1P0DJI8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAA1P0DJI8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAA1P0DJI8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms