Protein–RNA interactions for Protein: P0CAP2

POLR2M, DNA-directed RNA polymerase II subunit GRINL1A, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2MP0CAP2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2MP0CAP2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2MP0CAP2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2MP0CAP2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2MP0CAP2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2MP0CAP2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2MP0CAP2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR2MP0CAP2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR2MP0CAP2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR2MP0CAP2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR2MP0CAP2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR2MP0CAP2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR2MP0CAP2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR2MP0CAP2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR2MP0CAP2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR2MP0CAP2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR2MP0CAP2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR2MP0CAP2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR2MP0CAP2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR2MP0CAP2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR2MP0CAP2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR2MP0CAP2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR2MP0CAP2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR2MP0CAP2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR2MP0CAP2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR2MP0CAP2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR2MP0CAP2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR2MP0CAP2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR2MP0CAP2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR2MP0CAP2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR2MP0CAP2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR2MP0CAP2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR2MP0CAP2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR2MP0CAP2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR2MP0CAP2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR2MP0CAP2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR2MP0CAP2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR2MP0CAP2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR2MP0CAP2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR2MP0CAP2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR2MP0CAP2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR2MP0CAP2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR2MP0CAP2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR2MP0CAP2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR2MP0CAP2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR2MP0CAP2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR2MP0CAP2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR2MP0CAP2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR2MP0CAP2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR2MP0CAP2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR2MP0CAP2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR2MP0CAP2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR2MP0CAP2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR2MP0CAP2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR2MP0CAP2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR2MP0CAP2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR2MP0CAP2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR2MP0CAP2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR2MP0CAP2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms