Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00032P0C843 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms