Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms