Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPM2P07951 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPM2P07951 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPM2P07951 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPM2P07951 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPM2P07951 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TPM2P07951 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPM2P07951 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPM2P07951 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPM2P07951 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TPM2P07951 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TPM2P07951 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TPM2P07951 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TPM2P07951 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TPM2P07951 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TPM2P07951 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TPM2P07951 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TPM2P07951 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPM2P07951 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPM2P07951 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPM2P07951 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPM2P07951 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPM2P07951 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPM2P07951 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPM2P07951 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPM2P07951 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPM2P07951 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPM2P07951 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPM2P07951 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPM2P07951 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TPM2P07951 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TPM2P07951 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPM2P07951 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPM2P07951 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPM2P07951 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPM2P07951 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TPM2P07951 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TPM2P07951 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TPM2P07951 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TPM2P07951 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TPM2P07951 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TPM2P07951 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TPM2P07951 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TPM2P07951 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TPM2P07951 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TPM2P07951 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TPM2P07951 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TPM2P07951 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TPM2P07951 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TPM2P07951 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TPM2P07951 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TPM2P07951 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TPM2P07951 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TPM2P07951 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TPM2P07951 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TPM2P07951 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TPM2P07951 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TPM2P07951 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TPM2P07951 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TPM2P07951 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TPM2P07951 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TPM2P07951 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPM2P07951 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPM2P07951 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPM2P07951 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPM2P07951 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPM2P07951 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPM2P07951 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPM2P07951 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPM2P07951 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPM2P07951 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TPM2P07951 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPM2P07951 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPM2P07951 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPM2P07951 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPM2P07951 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPM2P07951 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPM2P07951 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPM2P07951 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPM2P07951 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPM2P07951 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPM2P07951 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPM2P07951 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPM2P07951 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPM2P07951 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPM2P07951 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPM2P07951 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPM2P07951 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TPM2P07951 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPM2P07951 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPM2P07951 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPM2P07951 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPM2P07951 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPM2P07951 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPM2P07951 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPM2P07951 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPM2P07951 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPM2P07951 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPM2P07951 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPM2P07951 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms