Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTSLP07711 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTSLP07711 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSLP07711 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSLP07711 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSLP07711 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSLP07711 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSLP07711 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSLP07711 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSLP07711 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSLP07711 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSLP07711 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSLP07711 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSLP07711 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSLP07711 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSLP07711 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSLP07711 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSLP07711 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSLP07711 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSLP07711 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSLP07711 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSLP07711 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSLP07711 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSLP07711 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSLP07711 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSLP07711 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSLP07711 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSLP07711 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSLP07711 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSLP07711 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSLP07711 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSLP07711 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSLP07711 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSLP07711 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSLP07711 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSLP07711 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSLP07711 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSLP07711 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSLP07711 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSLP07711 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSLP07711 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSLP07711 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSLP07711 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSLP07711 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSLP07711 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSLP07711 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSLP07711 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSLP07711 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSLP07711 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSLP07711 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSLP07711 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSLP07711 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSLP07711 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSLP07711 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSLP07711 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSLP07711 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTSLP07711 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTSLP07711 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTSLP07711 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTSLP07711 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTSLP07711 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTSLP07711 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTSLP07711 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTSLP07711 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTSLP07711 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSLP07711 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSLP07711 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSLP07711 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSLP07711 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSLP07711 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSLP07711 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSLP07711 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSLP07711 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSLP07711 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSLP07711 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSLP07711 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSLP07711 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSLP07711 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSLP07711 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSLP07711 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSLP07711 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSLP07711 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSLP07711 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSLP07711 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSLP07711 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSLP07711 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSLP07711 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSLP07711 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSLP07711 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSLP07711 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSLP07711 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSLP07711 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSLP07711 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSLP07711 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSLP07711 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSLP07711 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSLP07711 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSLP07711 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSLP07711 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSLP07711 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms