Protein–RNA interactions for Protein: P06732

CKM, Creatine kinase M-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMP06732 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CKMP06732 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CKMP06732 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CKMP06732 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CKMP06732 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CKMP06732 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CKMP06732 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CKMP06732 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CKMP06732 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CKMP06732 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CKMP06732 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CKMP06732 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CKMP06732 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CKMP06732 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CKMP06732 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CKMP06732 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CKMP06732 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CKMP06732 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CKMP06732 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CKMP06732 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CKMP06732 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CKMP06732 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CKMP06732 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CKMP06732 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CKMP06732 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CKMP06732 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CKMP06732 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CKMP06732 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CKMP06732 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CKMP06732 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CKMP06732 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CKMP06732 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CKMP06732 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CKMP06732 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CKMP06732 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CKMP06732 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CKMP06732 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CKMP06732 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKMP06732 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKMP06732 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKMP06732 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKMP06732 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKMP06732 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CKMP06732 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKMP06732 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKMP06732 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKMP06732 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKMP06732 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKMP06732 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKMP06732 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKMP06732 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CKMP06732 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CKMP06732 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CKMP06732 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CKMP06732 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CKMP06732 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CKMP06732 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CKMP06732 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CKMP06732 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CKMP06732 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CKMP06732 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CKMP06732 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CKMP06732 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CKMP06732 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CKMP06732 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CKMP06732 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CKMP06732 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CKMP06732 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CKMP06732 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CKMP06732 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CKMP06732 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CKMP06732 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CKMP06732 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CKMP06732 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CKMP06732 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CKMP06732 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CKMP06732 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CKMP06732 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CKMP06732 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CKMP06732 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CKMP06732 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CKMP06732 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CKMP06732 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CKMP06732 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CKMP06732 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CKMP06732 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CKMP06732 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CKMP06732 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CKMP06732 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CKMP06732 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CKMP06732 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CKMP06732 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CKMP06732 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CKMP06732 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CKMP06732 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CKMP06732 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CKMP06732 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CKMP06732 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CKMP06732 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CKMP06732 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms