Protein–RNA interactions for Protein: P06730

EIF4E, Eukaryotic translation initiation factor 4E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EP06730 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EIF4EP06730 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
EIF4EP06730 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EIF4EP06730 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EIF4EP06730 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EIF4EP06730 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EIF4EP06730 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EIF4EP06730 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EIF4EP06730 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EIF4EP06730 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EIF4EP06730 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EIF4EP06730 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EIF4EP06730 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EIF4EP06730 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms