Protein–RNA interactions for Protein: P05549

TFAP2A, Transcription factor AP-2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2AP05549 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms