Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR3DP05423 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR3DP05423 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR3DP05423 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR3DP05423 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR3DP05423 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR3DP05423 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR3DP05423 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR3DP05423 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR3DP05423 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR3DP05423 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR3DP05423 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR3DP05423 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR3DP05423 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR3DP05423 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR3DP05423 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR3DP05423 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR3DP05423 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR3DP05423 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR3DP05423 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR3DP05423 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR3DP05423 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR3DP05423 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR3DP05423 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR3DP05423 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR3DP05423 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR3DP05423 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR3DP05423 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR3DP05423 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR3DP05423 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR3DP05423 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR3DP05423 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR3DP05423 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR3DP05423 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR3DP05423 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR3DP05423 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR3DP05423 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR3DP05423 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR3DP05423 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR3DP05423 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR3DP05423 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR3DP05423 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR3DP05423 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR3DP05423 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR3DP05423 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR3DP05423 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR3DP05423 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR3DP05423 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR3DP05423 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR3DP05423 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR3DP05423 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR3DP05423 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR3DP05423 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLR3DP05423 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLR3DP05423 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLR3DP05423 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLR3DP05423 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLR3DP05423 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLR3DP05423 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLR3DP05423 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLR3DP05423 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
POLR3DP05423 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms