Protein–RNA interactions for Protein: P05230

FGF1, Fibroblast growth factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF1P05230 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGF1P05230 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGF1P05230 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGF1P05230 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGF1P05230 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGF1P05230 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGF1P05230 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGF1P05230 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGF1P05230 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FGF1P05230 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FGF1P05230 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FGF1P05230 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGF1P05230 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGF1P05230 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGF1P05230 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGF1P05230 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGF1P05230 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGF1P05230 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGF1P05230 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGF1P05230 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGF1P05230 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGF1P05230 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGF1P05230 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGF1P05230 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGF1P05230 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGF1P05230 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGF1P05230 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGF1P05230 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGF1P05230 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGF1P05230 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGF1P05230 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGF1P05230 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGF1P05230 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FGF1P05230 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGF1P05230 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGF1P05230 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FGF1P05230 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FGF1P05230 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FGF1P05230 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
FGF1P05230 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FGF1P05230 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGF1P05230 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGF1P05230 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGF1P05230 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGF1P05230 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGF1P05230 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGF1P05230 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGF1P05230 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGF1P05230 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGF1P05230 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGF1P05230 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FGF1P05230 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGF1P05230 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FGF1P05230 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGF1P05230 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGF1P05230 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGF1P05230 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGF1P05230 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGF1P05230 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGF1P05230 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGF1P05230 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGF1P05230 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGF1P05230 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGF1P05230 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGF1P05230 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGF1P05230 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGF1P05230 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGF1P05230 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGF1P05230 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGF1P05230 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGF1P05230 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGF1P05230 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGF1P05230 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGF1P05230 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGF1P05230 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGF1P05230 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGF1P05230 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGF1P05230 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGF1P05230 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGF1P05230 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGF1P05230 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGF1P05230 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGF1P05230 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGF1P05230 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGF1P05230 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGF1P05230 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGF1P05230 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGF1P05230 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGF1P05230 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGF1P05230 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGF1P05230 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGF1P05230 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGF1P05230 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGF1P05230 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGF1P05230 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGF1P05230 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGF1P05230 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGF1P05230 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGF1P05230 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FGF1P05230 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms