Protein–RNA interactions for Protein: P05166

PCCB, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCBP05166 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCCBP05166 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCCBP05166 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCCBP05166 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCCBP05166 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCCBP05166 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCCBP05166 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCCBP05166 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCCBP05166 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCCBP05166 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCCBP05166 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCCBP05166 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCCBP05166 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCCBP05166 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCCBP05166 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PCCBP05166 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCCBP05166 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCCBP05166 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCCBP05166 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCCBP05166 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCCBP05166 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCCBP05166 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCCBP05166 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCCBP05166 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PCCBP05166 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCCBP05166 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCCBP05166 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCCBP05166 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCCBP05166 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCCBP05166 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCCBP05166 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCCBP05166 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCCBP05166 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCCBP05166 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCCBP05166 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCCBP05166 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCCBP05166 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCCBP05166 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCCBP05166 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCCBP05166 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCCBP05166 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCCBP05166 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCCBP05166 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCCBP05166 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCCBP05166 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCCBP05166 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCCBP05166 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCCBP05166 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCCBP05166 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCCBP05166 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCCBP05166 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCCBP05166 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PCCBP05166 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PCCBP05166 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCCBP05166 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCCBP05166 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCCBP05166 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCCBP05166 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCCBP05166 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PCCBP05166 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCCBP05166 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCCBP05166 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCCBP05166 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCCBP05166 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCCBP05166 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PCCBP05166 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCCBP05166 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCCBP05166 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PCCBP05166 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCCBP05166 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCCBP05166 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCCBP05166 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PCCBP05166 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCCBP05166 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PCCBP05166 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCCBP05166 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PCCBP05166 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCCBP05166 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCCBP05166 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCCBP05166 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCCBP05166 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCCBP05166 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCCBP05166 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCCBP05166 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCCBP05166 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCCBP05166 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PCCBP05166 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCCBP05166 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCCBP05166 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCCBP05166 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCCBP05166 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCCBP05166 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCCBP05166 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCCBP05166 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PCCBP05166 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCCBP05166 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PCCBP05166 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCCBP05166 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCCBP05166 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCCBP05166 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms