Protein–RNA interactions for Protein: P05129

PRKCG, Protein kinase C gamma type, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCGP05129 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKCGP05129 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms