Protein–RNA interactions for Protein: P04554

PRM2, Protamine-2, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM2P04554 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRM2P04554 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRM2P04554 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PRM2P04554 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRM2P04554 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PRM2P04554 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRM2P04554 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRM2P04554 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRM2P04554 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRM2P04554 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRM2P04554 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRM2P04554 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRM2P04554 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRM2P04554 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRM2P04554 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRM2P04554 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRM2P04554 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRM2P04554 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRM2P04554 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRM2P04554 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PRM2P04554 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRM2P04554 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRM2P04554 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRM2P04554 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRM2P04554 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRM2P04554 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRM2P04554 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRM2P04554 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRM2P04554 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRM2P04554 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRM2P04554 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRM2P04554 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRM2P04554 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRM2P04554 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRM2P04554 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRM2P04554 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRM2P04554 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRM2P04554 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRM2P04554 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRM2P04554 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRM2P04554 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRM2P04554 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRM2P04554 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRM2P04554 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRM2P04554 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PRM2P04554 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRM2P04554 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRM2P04554 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRM2P04554 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRM2P04554 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRM2P04554 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRM2P04554 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRM2P04554 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRM2P04554 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRM2P04554 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRM2P04554 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRM2P04554 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRM2P04554 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRM2P04554 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PRM2P04554 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRM2P04554 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRM2P04554 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRM2P04554 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRM2P04554 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRM2P04554 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRM2P04554 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRM2P04554 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRM2P04554 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRM2P04554 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRM2P04554 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRM2P04554 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRM2P04554 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRM2P04554 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRM2P04554 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PRM2P04554 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRM2P04554 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRM2P04554 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRM2P04554 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRM2P04554 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRM2P04554 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRM2P04554 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRM2P04554 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRM2P04554 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRM2P04554 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRM2P04554 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRM2P04554 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRM2P04554 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRM2P04554 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRM2P04554 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRM2P04554 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PRM2P04554 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRM2P04554 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRM2P04554 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRM2P04554 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRM2P04554 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRM2P04554 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRM2P04554 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRM2P04554 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRM2P04554 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRM2P04554 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms