Protein–RNA interactions for Protein: P04259

KRT6B, Keratin, type II cytoskeletal 6B, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6BP04259 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT6BP04259 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT6BP04259 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT6BP04259 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT6BP04259 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT6BP04259 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT6BP04259 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT6BP04259 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT6BP04259 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT6BP04259 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT6BP04259 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT6BP04259 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT6BP04259 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT6BP04259 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT6BP04259 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT6BP04259 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT6BP04259 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT6BP04259 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT6BP04259 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT6BP04259 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT6BP04259 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT6BP04259 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT6BP04259 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT6BP04259 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT6BP04259 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT6BP04259 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT6BP04259 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT6BP04259 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT6BP04259 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT6BP04259 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT6BP04259 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT6BP04259 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms