Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VTNP04004 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VTNP04004 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VTNP04004 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VTNP04004 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VTNP04004 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VTNP04004 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VTNP04004 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VTNP04004 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VTNP04004 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
VTNP04004 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VTNP04004 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VTNP04004 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VTNP04004 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VTNP04004 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VTNP04004 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VTNP04004 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VTNP04004 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VTNP04004 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VTNP04004 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VTNP04004 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VTNP04004 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VTNP04004 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VTNP04004 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VTNP04004 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VTNP04004 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VTNP04004 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VTNP04004 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VTNP04004 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VTNP04004 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VTNP04004 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VTNP04004 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VTNP04004 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VTNP04004 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VTNP04004 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VTNP04004 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VTNP04004 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VTNP04004 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VTNP04004 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VTNP04004 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VTNP04004 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VTNP04004 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VTNP04004 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VTNP04004 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VTNP04004 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VTNP04004 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VTNP04004 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VTNP04004 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VTNP04004 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VTNP04004 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VTNP04004 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VTNP04004 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VTNP04004 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VTNP04004 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VTNP04004 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VTNP04004 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VTNP04004 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VTNP04004 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
VTNP04004 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VTNP04004 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VTNP04004 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VTNP04004 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VTNP04004 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VTNP04004 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VTNP04004 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VTNP04004 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VTNP04004 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VTNP04004 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VTNP04004 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VTNP04004 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
VTNP04004 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
VTNP04004 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VTNP04004 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VTNP04004 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VTNP04004 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VTNP04004 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VTNP04004 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VTNP04004 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VTNP04004 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VTNP04004 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VTNP04004 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VTNP04004 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VTNP04004 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VTNP04004 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
VTNP04004 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
VTNP04004 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VTNP04004 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
VTNP04004 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
VTNP04004 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VTNP04004 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VTNP04004 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
VTNP04004 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VTNP04004 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VTNP04004 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VTNP04004 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VTNP04004 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VTNP04004 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VTNP04004 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VTNP04004 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VTNP04004 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms