Protein–RNA interactions for Protein: P02655

APOC2, Apolipoprotein C-II, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC2P02655 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOC2P02655 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOC2P02655 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOC2P02655 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
APOC2P02655 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
APOC2P02655 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOC2P02655 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOC2P02655 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
APOC2P02655 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOC2P02655 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOC2P02655 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOC2P02655 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOC2P02655 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOC2P02655 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOC2P02655 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOC2P02655 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOC2P02655 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOC2P02655 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOC2P02655 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOC2P02655 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOC2P02655 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
APOC2P02655 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
APOC2P02655 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
APOC2P02655 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOC2P02655 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOC2P02655 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOC2P02655 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOC2P02655 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOC2P02655 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOC2P02655 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOC2P02655 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOC2P02655 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
APOC2P02655 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOC2P02655 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOC2P02655 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOC2P02655 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOC2P02655 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOC2P02655 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOC2P02655 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOC2P02655 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
APOC2P02655 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOC2P02655 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOC2P02655 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOC2P02655 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOC2P02655 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
APOC2P02655 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOC2P02655 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOC2P02655 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOC2P02655 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOC2P02655 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOC2P02655 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOC2P02655 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOC2P02655 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOC2P02655 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOC2P02655 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOC2P02655 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOC2P02655 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOC2P02655 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOC2P02655 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOC2P02655 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOC2P02655 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOC2P02655 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOC2P02655 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOC2P02655 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOC2P02655 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOC2P02655 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOC2P02655 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOC2P02655 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOC2P02655 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOC2P02655 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOC2P02655 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOC2P02655 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
APOC2P02655 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOC2P02655 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOC2P02655 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOC2P02655 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOC2P02655 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOC2P02655 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOC2P02655 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOC2P02655 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOC2P02655 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOC2P02655 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOC2P02655 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOC2P02655 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOC2P02655 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOC2P02655 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
APOC2P02655 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOC2P02655 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
APOC2P02655 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOC2P02655 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOC2P02655 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOC2P02655 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOC2P02655 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOC2P02655 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOC2P02655 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOC2P02655 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
APOC2P02655 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOC2P02655 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOC2P02655 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOC2P02655 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms