Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOC1P02654 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOC1P02654 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOC1P02654 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOC1P02654 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOC1P02654 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOC1P02654 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOC1P02654 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOC1P02654 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOC1P02654 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOC1P02654 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOC1P02654 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOC1P02654 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOC1P02654 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOC1P02654 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOC1P02654 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOC1P02654 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOC1P02654 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOC1P02654 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOC1P02654 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOC1P02654 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOC1P02654 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOC1P02654 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOC1P02654 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOC1P02654 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
APOC1P02654 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
APOC1P02654 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
APOC1P02654 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
APOC1P02654 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
APOC1P02654 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
APOC1P02654 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
APOC1P02654 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOC1P02654 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOC1P02654 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOC1P02654 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOC1P02654 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOC1P02654 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOC1P02654 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOC1P02654 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOC1P02654 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOC1P02654 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOC1P02654 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOC1P02654 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOC1P02654 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOC1P02654 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOC1P02654 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOC1P02654 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOC1P02654 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOC1P02654 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOC1P02654 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOC1P02654 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOC1P02654 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOC1P02654 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOC1P02654 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOC1P02654 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
APOC1P02654 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOC1P02654 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOC1P02654 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOC1P02654 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOC1P02654 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOC1P02654 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOC1P02654 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOC1P02654 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOC1P02654 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOC1P02654 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
APOC1P02654 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOC1P02654 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOC1P02654 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOC1P02654 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOC1P02654 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
APOC1P02654 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOC1P02654 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOC1P02654 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOC1P02654 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOC1P02654 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOC1P02654 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOC1P02654 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOC1P02654 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
APOC1P02654 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOC1P02654 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOC1P02654 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOC1P02654 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOC1P02654 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOC1P02654 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOC1P02654 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOC1P02654 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOC1P02654 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOC1P02654 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOC1P02654 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOC1P02654 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOC1P02654 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOC1P02654 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOC1P02654 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOC1P02654 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOC1P02654 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOC1P02654 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOC1P02654 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOC1P02654 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
APOC1P02654 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOC1P02654 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms