Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms