Protein–RNA interactions for Protein: P01033

TIMP1, Metalloproteinase inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP1P01033 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TIMP1P01033 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TIMP1P01033 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TIMP1P01033 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TIMP1P01033 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TIMP1P01033 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TIMP1P01033 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TIMP1P01033 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TIMP1P01033 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TIMP1P01033 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TIMP1P01033 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TIMP1P01033 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TIMP1P01033 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TIMP1P01033 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TIMP1P01033 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TIMP1P01033 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TIMP1P01033 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TIMP1P01033 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TIMP1P01033 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TIMP1P01033 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TIMP1P01033 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TIMP1P01033 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TIMP1P01033 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TIMP1P01033 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TIMP1P01033 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TIMP1P01033 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TIMP1P01033 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TIMP1P01033 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TIMP1P01033 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TIMP1P01033 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TIMP1P01033 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TIMP1P01033 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TIMP1P01033 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TIMP1P01033 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TIMP1P01033 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TIMP1P01033 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TIMP1P01033 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TIMP1P01033 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TIMP1P01033 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TIMP1P01033 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TIMP1P01033 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TIMP1P01033 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TIMP1P01033 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TIMP1P01033 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TIMP1P01033 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TIMP1P01033 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TIMP1P01033 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TIMP1P01033 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TIMP1P01033 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TIMP1P01033 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TIMP1P01033 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TIMP1P01033 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TIMP1P01033 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TIMP1P01033 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TIMP1P01033 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TIMP1P01033 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TIMP1P01033 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TIMP1P01033 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TIMP1P01033 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TIMP1P01033 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TIMP1P01033 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TIMP1P01033 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TIMP1P01033 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TIMP1P01033 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TIMP1P01033 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TIMP1P01033 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TIMP1P01033 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TIMP1P01033 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TIMP1P01033 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TIMP1P01033 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TIMP1P01033 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TIMP1P01033 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TIMP1P01033 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TIMP1P01033 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TIMP1P01033 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TIMP1P01033 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TIMP1P01033 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TIMP1P01033 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TIMP1P01033 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TIMP1P01033 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TIMP1P01033 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TIMP1P01033 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TIMP1P01033 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TIMP1P01033 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TIMP1P01033 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TIMP1P01033 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TIMP1P01033 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TIMP1P01033 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TIMP1P01033 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TIMP1P01033 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TIMP1P01033 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TIMP1P01033 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TIMP1P01033 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TIMP1P01033 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TIMP1P01033 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TIMP1P01033 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TIMP1P01033 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TIMP1P01033 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TIMP1P01033 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TIMP1P01033 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms