Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
APBA3O96018 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
APBA3O96018 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
APBA3O96018 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
APBA3O96018 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
APBA3O96018 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
APBA3O96018 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
APBA3O96018 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
APBA3O96018 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
APBA3O96018 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
APBA3O96018 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
APBA3O96018 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
APBA3O96018 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
APBA3O96018 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
APBA3O96018 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
APBA3O96018 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
APBA3O96018 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
APBA3O96018 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
APBA3O96018 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
APBA3O96018 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
APBA3O96018 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
APBA3O96018 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
APBA3O96018 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
APBA3O96018 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
APBA3O96018 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
APBA3O96018 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
APBA3O96018 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
APBA3O96018 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
APBA3O96018 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
APBA3O96018 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
APBA3O96018 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
APBA3O96018 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
APBA3O96018 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
APBA3O96018 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
APBA3O96018 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
APBA3O96018 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
APBA3O96018 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
APBA3O96018 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
APBA3O96018 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
APBA3O96018 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
APBA3O96018 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
APBA3O96018 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
APBA3O96018 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
APBA3O96018 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
APBA3O96018 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
APBA3O96018 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
APBA3O96018 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
APBA3O96018 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
APBA3O96018 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
APBA3O96018 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
APBA3O96018 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
APBA3O96018 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
APBA3O96018 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
APBA3O96018 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
APBA3O96018 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
APBA3O96018 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
APBA3O96018 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
APBA3O96018 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
APBA3O96018 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
APBA3O96018 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
APBA3O96018 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
APBA3O96018 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
APBA3O96018 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
APBA3O96018 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
APBA3O96018 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
APBA3O96018 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
APBA3O96018 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
APBA3O96018 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
APBA3O96018 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
APBA3O96018 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
APBA3O96018 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
APBA3O96018 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
APBA3O96018 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
APBA3O96018 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
APBA3O96018 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
APBA3O96018 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
APBA3O96018 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
APBA3O96018 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
APBA3O96018 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
APBA3O96018 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
APBA3O96018 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
APBA3O96018 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
APBA3O96018 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
APBA3O96018 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
APBA3O96018 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
APBA3O96018 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
APBA3O96018 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
APBA3O96018 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
APBA3O96018 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
APBA3O96018 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
APBA3O96018 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
APBA3O96018 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
APBA3O96018 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
APBA3O96018 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
APBA3O96018 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
APBA3O96018 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
APBA3O96018 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
APBA3O96018 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
APBA3O96018 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
APBA3O96018 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms