Protein–RNA interactions for Protein: O96011

PEX11B, Peroxisomal membrane protein 11B, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX11BO96011 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms