Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZBED1O96006 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
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