Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCNTO95613 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCNTO95613 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCNTO95613 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCNTO95613 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCNTO95613 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCNTO95613 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCNTO95613 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCNTO95613 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCNTO95613 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCNTO95613 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCNTO95613 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCNTO95613 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCNTO95613 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCNTO95613 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCNTO95613 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCNTO95613 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCNTO95613 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCNTO95613 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCNTO95613 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCNTO95613 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCNTO95613 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCNTO95613 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCNTO95613 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCNTO95613 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCNTO95613 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCNTO95613 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCNTO95613 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCNTO95613 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCNTO95613 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCNTO95613 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCNTO95613 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCNTO95613 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCNTO95613 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCNTO95613 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCNTO95613 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCNTO95613 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCNTO95613 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCNTO95613 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCNTO95613 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCNTO95613 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCNTO95613 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PCNTO95613 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCNTO95613 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCNTO95613 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PCNTO95613 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCNTO95613 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCNTO95613 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCNTO95613 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCNTO95613 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCNTO95613 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCNTO95613 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCNTO95613 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCNTO95613 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCNTO95613 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCNTO95613 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCNTO95613 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCNTO95613 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PCNTO95613 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCNTO95613 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCNTO95613 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCNTO95613 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCNTO95613 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PCNTO95613 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCNTO95613 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCNTO95613 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCNTO95613 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCNTO95613 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCNTO95613 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCNTO95613 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCNTO95613 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCNTO95613 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCNTO95613 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCNTO95613 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCNTO95613 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCNTO95613 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCNTO95613 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCNTO95613 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCNTO95613 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCNTO95613 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PCNTO95613 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PCNTO95613 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCNTO95613 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCNTO95613 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCNTO95613 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCNTO95613 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCNTO95613 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCNTO95613 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCNTO95613 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCNTO95613 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCNTO95613 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCNTO95613 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCNTO95613 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCNTO95613 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PCNTO95613 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PCNTO95613 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PCNTO95613 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PCNTO95613 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
PCNTO95613 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PCNTO95613 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms