Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
POLR1AO95602 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
POLR1AO95602 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
POLR1AO95602 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
POLR1AO95602 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
POLR1AO95602 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
POLR1AO95602 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
POLR1AO95602 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
POLR1AO95602 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
POLR1AO95602 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
POLR1AO95602 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
POLR1AO95602 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
POLR1AO95602 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
POLR1AO95602 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
POLR1AO95602 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
POLR1AO95602 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
POLR1AO95602 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
POLR1AO95602 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
POLR1AO95602 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
POLR1AO95602 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
POLR1AO95602 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
POLR1AO95602 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
POLR1AO95602 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
POLR1AO95602 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
POLR1AO95602 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
POLR1AO95602 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
POLR1AO95602 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
POLR1AO95602 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
POLR1AO95602 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
POLR1AO95602 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
POLR1AO95602 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
POLR1AO95602 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
POLR1AO95602 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
POLR1AO95602 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
POLR1AO95602 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
POLR1AO95602 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
POLR1AO95602 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
POLR1AO95602 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
POLR1AO95602 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
POLR1AO95602 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
POLR1AO95602 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
POLR1AO95602 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
POLR1AO95602 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
POLR1AO95602 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
POLR1AO95602 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
POLR1AO95602 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
POLR1AO95602 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
POLR1AO95602 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
POLR1AO95602 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
POLR1AO95602 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
POLR1AO95602 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
POLR1AO95602 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
POLR1AO95602 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
POLR1AO95602 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
POLR1AO95602 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
POLR1AO95602 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
POLR1AO95602 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
POLR1AO95602 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
POLR1AO95602 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
POLR1AO95602 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
POLR1AO95602 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
POLR1AO95602 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
POLR1AO95602 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
POLR1AO95602 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
POLR1AO95602 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
POLR1AO95602 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
POLR1AO95602 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
POLR1AO95602 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
POLR1AO95602 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
POLR1AO95602 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
POLR1AO95602 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
POLR1AO95602 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC32.57■■■□□ 2.8
POLR1AO95602 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
POLR1AO95602 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
POLR1AO95602 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
POLR1AO95602 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
POLR1AO95602 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
POLR1AO95602 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
POLR1AO95602 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
POLR1AO95602 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
POLR1AO95602 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
POLR1AO95602 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
POLR1AO95602 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
POLR1AO95602 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
POLR1AO95602 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
POLR1AO95602 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
POLR1AO95602 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
POLR1AO95602 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
POLR1AO95602 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
POLR1AO95602 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
POLR1AO95602 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
POLR1AO95602 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
POLR1AO95602 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC32.54■■■□□ 2.8
POLR1AO95602 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
POLR1AO95602 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
POLR1AO95602 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
POLR1AO95602 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
POLR1AO95602 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
POLR1AO95602 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
POLR1AO95602 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms