Protein–RNA interactions for Protein: O95522

PRAMEF12, PRAME family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF12O95522 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms