Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCB11O95342 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCB11O95342 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCB11O95342 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCB11O95342 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCB11O95342 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCB11O95342 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCB11O95342 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCB11O95342 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCB11O95342 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCB11O95342 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCB11O95342 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCB11O95342 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCB11O95342 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCB11O95342 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCB11O95342 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCB11O95342 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCB11O95342 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCB11O95342 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCB11O95342 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCB11O95342 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCB11O95342 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCB11O95342 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCB11O95342 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCB11O95342 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCB11O95342 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCB11O95342 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCB11O95342 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCB11O95342 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCB11O95342 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCB11O95342 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCB11O95342 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCB11O95342 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCB11O95342 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCB11O95342 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCB11O95342 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCB11O95342 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCB11O95342 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCB11O95342 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCB11O95342 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCB11O95342 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCB11O95342 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCB11O95342 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCB11O95342 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCB11O95342 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCB11O95342 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCB11O95342 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCB11O95342 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCB11O95342 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCB11O95342 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCB11O95342 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCB11O95342 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCB11O95342 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCB11O95342 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCB11O95342 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCB11O95342 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCB11O95342 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCB11O95342 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCB11O95342 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCB11O95342 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCB11O95342 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCB11O95342 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCB11O95342 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCB11O95342 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCB11O95342 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCB11O95342 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCB11O95342 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCB11O95342 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCB11O95342 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCB11O95342 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCB11O95342 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCB11O95342 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCB11O95342 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCB11O95342 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCB11O95342 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCB11O95342 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCB11O95342 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCB11O95342 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCB11O95342 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCB11O95342 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCB11O95342 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCB11O95342 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCB11O95342 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCB11O95342 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCB11O95342 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCB11O95342 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCB11O95342 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCB11O95342 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCB11O95342 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCB11O95342 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCB11O95342 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCB11O95342 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCB11O95342 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCB11O95342 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCB11O95342 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms