Protein–RNA interactions for Protein: O95104

SCAF4, Splicing factor, arginine/serine-rich 15, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF4O95104 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCAF4O95104 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCAF4O95104 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCAF4O95104 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCAF4O95104 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCAF4O95104 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCAF4O95104 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCAF4O95104 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCAF4O95104 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCAF4O95104 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCAF4O95104 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCAF4O95104 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCAF4O95104 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCAF4O95104 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCAF4O95104 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCAF4O95104 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCAF4O95104 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCAF4O95104 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCAF4O95104 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCAF4O95104 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCAF4O95104 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms