Protein–RNA interactions for Protein: O94900

TOX, Thymocyte selection-associated high mobility group box protein TOX, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOXO94900 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TOXO94900 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TOXO94900 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TOXO94900 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TOXO94900 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TOXO94900 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TOXO94900 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TOXO94900 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TOXO94900 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TOXO94900 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TOXO94900 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TOXO94900 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TOXO94900 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TOXO94900 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TOXO94900 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TOXO94900 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TOXO94900 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TOXO94900 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TOXO94900 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TOXO94900 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TOXO94900 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TOXO94900 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TOXO94900 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TOXO94900 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TOXO94900 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TOXO94900 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TOXO94900 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TOXO94900 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TOXO94900 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TOXO94900 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TOXO94900 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TOXO94900 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TOXO94900 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TOXO94900 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TOXO94900 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TOXO94900 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TOXO94900 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TOXO94900 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TOXO94900 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TOXO94900 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TOXO94900 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TOXO94900 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TOXO94900 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TOXO94900 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TOXO94900 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TOXO94900 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TOXO94900 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TOXO94900 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TOXO94900 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TOXO94900 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TOXO94900 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TOXO94900 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TOXO94900 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TOXO94900 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TOXO94900 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TOXO94900 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TOXO94900 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TOXO94900 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TOXO94900 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TOXO94900 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TOXO94900 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TOXO94900 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TOXO94900 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TOXO94900 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TOXO94900 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TOXO94900 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TOXO94900 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TOXO94900 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TOXO94900 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TOXO94900 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TOXO94900 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TOXO94900 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TOXO94900 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TOXO94900 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TOXO94900 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TOXO94900 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TOXO94900 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TOXO94900 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TOXO94900 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TOXO94900 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TOXO94900 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TOXO94900 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TOXO94900 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TOXO94900 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TOXO94900 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TOXO94900 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TOXO94900 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TOXO94900 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TOXO94900 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TOXO94900 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TOXO94900 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TOXO94900 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TOXO94900 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TOXO94900 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TOXO94900 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TOXO94900 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TOXO94900 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TOXO94900 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TOXO94900 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TOXO94900 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms