Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCTN3O75935 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms