Protein–RNA interactions for Protein: O75419

CDC45, Cell division control protein 45 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC45O75419 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDC45O75419 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDC45O75419 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CDC45O75419 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDC45O75419 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDC45O75419 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDC45O75419 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDC45O75419 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CDC45O75419 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDC45O75419 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDC45O75419 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDC45O75419 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDC45O75419 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDC45O75419 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDC45O75419 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDC45O75419 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDC45O75419 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDC45O75419 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDC45O75419 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDC45O75419 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDC45O75419 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDC45O75419 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDC45O75419 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDC45O75419 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDC45O75419 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDC45O75419 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDC45O75419 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDC45O75419 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDC45O75419 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDC45O75419 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDC45O75419 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDC45O75419 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDC45O75419 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDC45O75419 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDC45O75419 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDC45O75419 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDC45O75419 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDC45O75419 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDC45O75419 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDC45O75419 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDC45O75419 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDC45O75419 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDC45O75419 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDC45O75419 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDC45O75419 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDC45O75419 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CDC45O75419 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDC45O75419 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDC45O75419 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CDC45O75419 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDC45O75419 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDC45O75419 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDC45O75419 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDC45O75419 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDC45O75419 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDC45O75419 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CDC45O75419 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDC45O75419 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDC45O75419 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDC45O75419 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CDC45O75419 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDC45O75419 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDC45O75419 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CDC45O75419 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDC45O75419 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDC45O75419 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDC45O75419 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CDC45O75419 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CDC45O75419 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDC45O75419 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CDC45O75419 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDC45O75419 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDC45O75419 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDC45O75419 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDC45O75419 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDC45O75419 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDC45O75419 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDC45O75419 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDC45O75419 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CDC45O75419 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CDC45O75419 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDC45O75419 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDC45O75419 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDC45O75419 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDC45O75419 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDC45O75419 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDC45O75419 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDC45O75419 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDC45O75419 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDC45O75419 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDC45O75419 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDC45O75419 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDC45O75419 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDC45O75419 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CDC45O75419 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDC45O75419 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDC45O75419 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDC45O75419 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDC45O75419 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDC45O75419 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms