Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB11FIP3O75154 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB11FIP3O75154 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB11FIP3O75154 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB11FIP3O75154 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB11FIP3O75154 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB11FIP3O75154 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB11FIP3O75154 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB11FIP3O75154 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB11FIP3O75154 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB11FIP3O75154 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB11FIP3O75154 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB11FIP3O75154 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB11FIP3O75154 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB11FIP3O75154 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB11FIP3O75154 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAB11FIP3O75154 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAB11FIP3O75154 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RAB11FIP3O75154 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAB11FIP3O75154 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAB11FIP3O75154 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAB11FIP3O75154 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RAB11FIP3O75154 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAB11FIP3O75154 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RAB11FIP3O75154 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB11FIP3O75154 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB11FIP3O75154 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB11FIP3O75154 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB11FIP3O75154 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB11FIP3O75154 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB11FIP3O75154 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB11FIP3O75154 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB11FIP3O75154 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB11FIP3O75154 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB11FIP3O75154 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB11FIP3O75154 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB11FIP3O75154 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB11FIP3O75154 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB11FIP3O75154 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB11FIP3O75154 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB11FIP3O75154 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB11FIP3O75154 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB11FIP3O75154 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB11FIP3O75154 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB11FIP3O75154 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB11FIP3O75154 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms