Protein–RNA interactions for Protein: O60393

NOBOX, Homeobox protein NOBOX, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOBOXO60393 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NOBOXO60393 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NOBOXO60393 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NOBOXO60393 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NOBOXO60393 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NOBOXO60393 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NOBOXO60393 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NOBOXO60393 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NOBOXO60393 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NOBOXO60393 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NOBOXO60393 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NOBOXO60393 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NOBOXO60393 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NOBOXO60393 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NOBOXO60393 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NOBOXO60393 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NOBOXO60393 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NOBOXO60393 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NOBOXO60393 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NOBOXO60393 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NOBOXO60393 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NOBOXO60393 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NOBOXO60393 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NOBOXO60393 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NOBOXO60393 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NOBOXO60393 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NOBOXO60393 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NOBOXO60393 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NOBOXO60393 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NOBOXO60393 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NOBOXO60393 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NOBOXO60393 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NOBOXO60393 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NOBOXO60393 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NOBOXO60393 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms