Protein–RNA interactions for Protein: O60356

NUPR1, Nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPR1O60356 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUPR1O60356 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms