Protein–RNA interactions for Protein: O60318

MCM3AP, Germinal-center associated nuclear protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3APO60318 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCM3APO60318 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MCM3APO60318 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MCM3APO60318 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCM3APO60318 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCM3APO60318 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCM3APO60318 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCM3APO60318 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCM3APO60318 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCM3APO60318 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCM3APO60318 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCM3APO60318 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCM3APO60318 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCM3APO60318 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCM3APO60318 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCM3APO60318 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCM3APO60318 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCM3APO60318 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCM3APO60318 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCM3APO60318 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCM3APO60318 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCM3APO60318 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCM3APO60318 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCM3APO60318 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MCM3APO60318 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCM3APO60318 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCM3APO60318 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCM3APO60318 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCM3APO60318 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCM3APO60318 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCM3APO60318 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCM3APO60318 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCM3APO60318 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MCM3APO60318 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCM3APO60318 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCM3APO60318 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MCM3APO60318 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCM3APO60318 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCM3APO60318 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCM3APO60318 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCM3APO60318 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MCM3APO60318 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCM3APO60318 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCM3APO60318 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCM3APO60318 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCM3APO60318 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCM3APO60318 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCM3APO60318 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCM3APO60318 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCM3APO60318 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCM3APO60318 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCM3APO60318 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCM3APO60318 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCM3APO60318 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms