Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
KIAA0556O60303 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
KIAA0556O60303 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
KIAA0556O60303 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
KIAA0556O60303 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC35.7■■■■□ 3.31
KIAA0556O60303 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
KIAA0556O60303 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
KIAA0556O60303 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
KIAA0556O60303 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
KIAA0556O60303 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
KIAA0556O60303 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
KIAA0556O60303 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
KIAA0556O60303 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
KIAA0556O60303 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
KIAA0556O60303 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
KIAA0556O60303 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
KIAA0556O60303 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
KIAA0556O60303 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
KIAA0556O60303 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
KIAA0556O60303 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
KIAA0556O60303 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
KIAA0556O60303 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
KIAA0556O60303 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
KIAA0556O60303 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
KIAA0556O60303 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
KIAA0556O60303 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
KIAA0556O60303 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
KIAA0556O60303 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
KIAA0556O60303 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
KIAA0556O60303 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
KIAA0556O60303 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
KIAA0556O60303 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
KIAA0556O60303 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
KIAA0556O60303 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
KIAA0556O60303 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
KIAA0556O60303 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
KIAA0556O60303 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
KIAA0556O60303 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
KIAA0556O60303 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
KIAA0556O60303 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
KIAA0556O60303 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
KIAA0556O60303 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
KIAA0556O60303 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
KIAA0556O60303 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
KIAA0556O60303 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
KIAA0556O60303 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
KIAA0556O60303 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
KIAA0556O60303 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
KIAA0556O60303 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
KIAA0556O60303 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
KIAA0556O60303 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
KIAA0556O60303 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
KIAA0556O60303 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
KIAA0556O60303 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
KIAA0556O60303 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
KIAA0556O60303 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
KIAA0556O60303 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
KIAA0556O60303 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
KIAA0556O60303 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
KIAA0556O60303 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
KIAA0556O60303 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
KIAA0556O60303 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
KIAA0556O60303 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
KIAA0556O60303 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
KIAA0556O60303 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
KIAA0556O60303 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
KIAA0556O60303 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
KIAA0556O60303 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
KIAA0556O60303 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
KIAA0556O60303 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
KIAA0556O60303 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
KIAA0556O60303 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
KIAA0556O60303 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
KIAA0556O60303 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
KIAA0556O60303 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
KIAA0556O60303 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
KIAA0556O60303 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
KIAA0556O60303 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
KIAA0556O60303 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
KIAA0556O60303 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
KIAA0556O60303 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
KIAA0556O60303 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
KIAA0556O60303 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
KIAA0556O60303 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
KIAA0556O60303 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
KIAA0556O60303 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
KIAA0556O60303 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
KIAA0556O60303 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
KIAA0556O60303 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
KIAA0556O60303 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
KIAA0556O60303 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.29
KIAA0556O60303 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC35.57■■■■□ 3.29
KIAA0556O60303 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
KIAA0556O60303 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
KIAA0556O60303 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC35.57■■■■□ 3.28
KIAA0556O60303 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
KIAA0556O60303 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
KIAA0556O60303 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
KIAA0556O60303 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
KIAA0556O60303 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms