Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PLIN1O60240 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PLIN1O60240 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PLIN1O60240 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PLIN1O60240 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PLIN1O60240 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PLIN1O60240 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PLIN1O60240 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PLIN1O60240 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PLIN1O60240 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PLIN1O60240 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PLIN1O60240 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PLIN1O60240 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PLIN1O60240 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PLIN1O60240 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PLIN1O60240 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PLIN1O60240 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PLIN1O60240 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PLIN1O60240 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PLIN1O60240 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PLIN1O60240 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PLIN1O60240 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PLIN1O60240 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PLIN1O60240 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PLIN1O60240 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PLIN1O60240 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PLIN1O60240 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PLIN1O60240 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PLIN1O60240 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PLIN1O60240 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PLIN1O60240 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PLIN1O60240 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PLIN1O60240 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PLIN1O60240 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PLIN1O60240 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PLIN1O60240 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PLIN1O60240 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PLIN1O60240 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PLIN1O60240 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PLIN1O60240 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PLIN1O60240 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PLIN1O60240 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PLIN1O60240 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PLIN1O60240 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PLIN1O60240 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PLIN1O60240 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PLIN1O60240 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PLIN1O60240 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PLIN1O60240 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PLIN1O60240 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PLIN1O60240 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PLIN1O60240 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PLIN1O60240 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PLIN1O60240 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PLIN1O60240 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PLIN1O60240 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PLIN1O60240 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PLIN1O60240 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PLIN1O60240 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PLIN1O60240 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PLIN1O60240 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PLIN1O60240 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PLIN1O60240 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PLIN1O60240 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PLIN1O60240 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PLIN1O60240 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PLIN1O60240 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PLIN1O60240 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PLIN1O60240 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PLIN1O60240 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PLIN1O60240 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PLIN1O60240 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PLIN1O60240 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PLIN1O60240 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PLIN1O60240 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PLIN1O60240 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PLIN1O60240 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PLIN1O60240 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PLIN1O60240 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PLIN1O60240 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PLIN1O60240 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PLIN1O60240 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PLIN1O60240 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PLIN1O60240 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PLIN1O60240 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PLIN1O60240 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PLIN1O60240 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PLIN1O60240 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PLIN1O60240 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PLIN1O60240 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PLIN1O60240 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PLIN1O60240 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PLIN1O60240 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PLIN1O60240 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PLIN1O60240 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PLIN1O60240 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PLIN1O60240 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PLIN1O60240 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PLIN1O60240 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PLIN1O60240 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms