Protein–RNA interactions for Protein: O43709

BUD23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD23O43709 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BUD23O43709 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BUD23O43709 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BUD23O43709 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BUD23O43709 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BUD23O43709 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BUD23O43709 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BUD23O43709 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BUD23O43709 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BUD23O43709 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BUD23O43709 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BUD23O43709 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BUD23O43709 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BUD23O43709 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BUD23O43709 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BUD23O43709 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BUD23O43709 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
BUD23O43709 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BUD23O43709 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BUD23O43709 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BUD23O43709 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BUD23O43709 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BUD23O43709 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BUD23O43709 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BUD23O43709 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BUD23O43709 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BUD23O43709 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BUD23O43709 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BUD23O43709 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BUD23O43709 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BUD23O43709 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BUD23O43709 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BUD23O43709 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BUD23O43709 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BUD23O43709 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BUD23O43709 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BUD23O43709 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BUD23O43709 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BUD23O43709 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BUD23O43709 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BUD23O43709 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BUD23O43709 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BUD23O43709 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BUD23O43709 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BUD23O43709 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BUD23O43709 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BUD23O43709 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BUD23O43709 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BUD23O43709 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BUD23O43709 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BUD23O43709 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BUD23O43709 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BUD23O43709 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BUD23O43709 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BUD23O43709 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BUD23O43709 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BUD23O43709 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BUD23O43709 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BUD23O43709 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BUD23O43709 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BUD23O43709 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BUD23O43709 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BUD23O43709 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BUD23O43709 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BUD23O43709 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BUD23O43709 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BUD23O43709 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BUD23O43709 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BUD23O43709 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BUD23O43709 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BUD23O43709 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BUD23O43709 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BUD23O43709 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BUD23O43709 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BUD23O43709 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BUD23O43709 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BUD23O43709 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BUD23O43709 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BUD23O43709 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BUD23O43709 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BUD23O43709 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BUD23O43709 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BUD23O43709 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BUD23O43709 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BUD23O43709 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BUD23O43709 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BUD23O43709 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BUD23O43709 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BUD23O43709 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BUD23O43709 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BUD23O43709 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BUD23O43709 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BUD23O43709 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BUD23O43709 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BUD23O43709 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BUD23O43709 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BUD23O43709 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BUD23O43709 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BUD23O43709 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BUD23O43709 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms