Protein–RNA interactions for Protein: O43502

RAD51C, DNA repair protein RAD51 homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51CO43502 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD51CO43502 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD51CO43502 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD51CO43502 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD51CO43502 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD51CO43502 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD51CO43502 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD51CO43502 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD51CO43502 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD51CO43502 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD51CO43502 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD51CO43502 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD51CO43502 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD51CO43502 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD51CO43502 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD51CO43502 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD51CO43502 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD51CO43502 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD51CO43502 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD51CO43502 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD51CO43502 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAD51CO43502 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAD51CO43502 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAD51CO43502 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms